Die Geschäftsleitung führt die ganze Schule operativ. Der Geschäftsleitung gehören das Präsidium, die Leiterin Schulverwaltung und die Leitung Pädagogik an. Sie entscheidet im Rahmen der ihr erteilten Kompetenzen. Darüber hinaus fällt sie Entscheide, die den Vollzug von Erlassen betreffen und von untergeordneter Bedeutung oder dringlich sind.

Die Geschäftsleitung bereitet die Geschäftssitzungen der Schulpflege vor und trifft allenfalls Vorentscheidungen, im Sinne einer Auswahl aus verschiedenen Lösungsmöglichkeiten. Sie entscheidet einvernehmlich. Ist dies nicht möglich, entscheidet das Schulpräsidium. Den Vorsitz führt die Schulpräsidentin, die administrative Vor- und Nachbereitung besorgt die Leiterin Schulverwaltung.

Im Rahmen der ihr obliegenden Aufgaben und Kompetenzen ist die Geschäftsleitung gegenüber den Schulen und Diensten weisungsbefugt. Sie verfügt auch, in Vertretung der Schulpflege, über alle Kompetenzen im Rahmen des Budgets, und der zugeteilten Konten die sie zur Erfüllung ihrer Aufgaben benötigt.

Die Geschäftsleitung in der Regel wöchentlich, was eine effiziente Erledigung des Tagesgeschäfts der Schule ermöglicht.

Leiterin Schulverwaltung
Die Leiterin Schulverwaltung organisiert den Betrieb der Schulverwaltung. Zusätzlich ist die Leiterin Schulverwaltung die Aktuarin und Protokollführerin der Schulpflege. Vorgesetzte der Leiterin Schulverwaltung ist das Präsidium der Schulpflege.

Leitung Pädagogik
Die Leitung Pädagogik führt sämtliche Aufgaben der Schule Wallisellen von der Sache her. Die pädagogischen Dienste führt sie sowohl von der Sache her als auch personell. Auch ist ihr das Personal der Schulverwaltung unterstellt. Auch führt sie das Protokoll der Schulgemeindeversammlung. Vorgesetzte der Leitung Pädagogik ist das Präsidium der Schulpflege.